赣州函授本科的课程内容相对固定，学生需要按照课程表进行学习，课程设置较为规范。而自考本科的课程内容相对自由，学生可以根据个人兴趣和目标选择任意专业，自主学习相关课程。
教学方式。
赣州函授本科采取传统的面授教学方式，学生需要定时到学校参加课程学习。而自考本科采取自主学习的方式，学生可以根据自己的时间和能力进行学习，不存在时间和空间上的限制。
考试形式。
赣州函授本科的考试形式为闭卷考试，一般在学期结束时进行，考试内容与课程内容相对应。而自考本科的考试形式多样，包括闭卷考试、开卷考试、论文写作等。学生可以根据自己的实际情况选择适合自己的考试方式。
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